More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4869 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4869  phosphate acetyltransferase  100 
 
 
344 aa  688    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.70933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3501  phosphate acetyltransferase  64.55 
 
 
325 aa  431  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.85802  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1825  phosphate acetyl transferase  58.73 
 
 
341 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.468792  normal  0.990644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3772  phosphotransacetylase  57.49 
 
 
345 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4368  phosphate acetyltransferase  53.75 
 
 
344 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6206  phosphate acetyltransferase  52.12 
 
 
343 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235259  normal  0.547085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0690  phosphotransacetylase  53.42 
 
 
345 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00978626  normal  0.268816 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4009  phosphotransacetylase  54.21 
 
 
332 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4517  phosphate acetyltransferase  54.35 
 
 
363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.448767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1994  phosphotransacetylase  53.11 
 
 
344 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172621  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2847  phosphotransacetylase  57.65 
 
 
335 aa  309  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.233473  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1008  phosphate acetyltransferase  51.52 
 
 
318 aa  309  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4275  phosphate acetyltransferase  51.52 
 
 
318 aa  309  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1640  phosphate acetyltransferase  51.83 
 
 
318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1494  phosphate acetyltransferase  48 
 
 
332 aa  299  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000278764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1029  phosphotransacetylase  45.76 
 
 
358 aa  296  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0296281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10200  phosphate acetyltransferase  45.78 
 
 
332 aa  295  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000038792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1171  phosphate acetyltransferase  45.32 
 
 
334 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.910549  normal  0.174379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1614  phosphotransacetylase  44.04 
 
 
332 aa  285  9e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000537063  hitchhiker  9.00938e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1696  phosphotransacetylase  45.76 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.593384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1978  phosphotransacetylase  45.45 
 
 
333 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1728  phosphate acetyltransferase  46.18 
 
 
332 aa  277  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0293316  normal  0.0937658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2137  phosphate acetyltransferase  42.3 
 
 
331 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1035  phosphotransacetylase  45.48 
 
 
333 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000802178  hitchhiker  0.00000181375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2706  phosphate acetyltransferase  44.28 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.489379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1732  phosphotransacetylase  44.24 
 
 
332 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00629066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2542  phosphate acetyltransferase  45.43 
 
 
333 aa  272  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5955599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0646  phosphate acetyltransferase  46.2 
 
 
326 aa  271  8.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00657462  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2850  phosphate acetyl/butaryl transferase  46.67 
 
 
333 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1947  phosphate acetyltransferase  44.58 
 
 
333 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2276  phosphate acetyltransferase  44.58 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000840515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1210  phosphate acetyltransferase  43.33 
 
 
333 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3395  phosphate acetyltransferase  43.07 
 
 
333 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1290  phosphate acetyltransferase  42.73 
 
 
334 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382102  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1082  phosphotransacetylase  43.16 
 
 
336 aa  261  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5068  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5180  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5481  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5516  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5238  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5085  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5636  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5510  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5566  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5441  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3908  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1326  phosphate acetyltransferase  42.99 
 
 
331 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0780442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0767  phosphate acetyltransferase  41.64 
 
 
330 aa  255  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06290  phosphotransacetylase  42.94 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0250109 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1824  phosphotransacetylase  44.55 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3472  phosphotransacetylase  43.65 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  41.28 
 
 
702 aa  252  7e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3364  phosphotransacetylase  44.41 
 
 
324 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1231  phosphotransacetylase  44.83 
 
 
327 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1821  phosphotransacetylase  41.1 
 
 
333 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000135779  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0055  phosphate acetyltransferase  43.52 
 
 
692 aa  246  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0620  phosphate acetyltransferase  40.37 
 
 
334 aa  245  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00611746  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0414  phosphate acetyltransferase  41.64 
 
 
335 aa  245  8e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0236  phosphotransacetylase  43.71 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1092  phosphotransacetylase  42.63 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000027546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12240  phosphotransacetylase  43.12 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1296  phosphotransacetylase  42.38 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  40.91 
 
 
700 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  41.52 
 
 
703 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0042  phosphate acetyltransferase  41.49 
 
 
335 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2477  phosphate acetyltransferase  41.34 
 
 
715 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1420  phosphotransacetylase  44.76 
 
 
327 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00576115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  42.02 
 
 
720 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  40.48 
 
 
726 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2611  phosphotransacetylase  42.56 
 
 
338 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3679  phosphotransacetylase  42.86 
 
 
338 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2659  phosphotransacetylase  42.86 
 
 
338 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.918337  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2604  phosphotransacetylase  42.86 
 
 
338 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0611  phosphotransacetylase  43.53 
 
 
328 aa  238  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0626  phosphotransacetylase  43.53 
 
 
328 aa  238  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02349  predicted phosphotransacetylase subunit  42.86 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1212  phosphate acetyltransferase  42.86 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1219  phosphotransacetylase  42.86 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02311  hypothetical protein  42.86 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2587  phosphotransacetylase  42.86 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2726  phosphotransacetylase  42.86 
 
 
338 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335854  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2735  phosphotransacetylase  42.86 
 
 
338 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  41.67 
 
 
695 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0602  phosphate acetyltransferase  40.25 
 
 
351 aa  237  2e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1494  phosphate acetyltransferase  41.59 
 
 
712 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000825995  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  41.85 
 
 
707 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2700  phosphotransacetylase  42.56 
 
 
338 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2382  phosphate acetyltransferase  40.3 
 
 
717 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000517206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0700  phosphate acetyltransferase  42.46 
 
 
692 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0266359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1490  phosphate acetyltransferase  39.23 
 
 
717 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000130652  normal  0.921429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1466  phosphotransacetylase  44.65 
 
 
326 aa  236  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.334514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1551  phosphate acetyltransferase  40.18 
 
 
717 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0542172  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4072  phosphate acetyltransferase  43.08 
 
 
689 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  40.98 
 
 
712 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2781  phosphate acetyltransferase  41.72 
 
 
712 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000660033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  39.81 
 
 
702 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2694  phosphate acetyltransferase  39.35 
 
 
717 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2773  phosphate acetyltransferase  39.35 
 
 
717 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000126217  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2675  phosphate acetyltransferase  39.35 
 
 
717 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000376999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1690  phosphate acetyltransferase  39.35 
 
 
717 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000858344  normal  0.0172468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>