More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1640 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1640  phosphate acetyltransferase  100 
 
 
318 aa  622  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1008  phosphate acetyltransferase  99.69 
 
 
318 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4275  phosphate acetyltransferase  99.69 
 
 
318 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4009  phosphotransacetylase  76.95 
 
 
332 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3501  phosphate acetyltransferase  51.7 
 
 
325 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.85802  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4869  phosphate acetyltransferase  51.83 
 
 
344 aa  311  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.70933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3772  phosphotransacetylase  48.93 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6206  phosphate acetyltransferase  47.88 
 
 
343 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235259  normal  0.547085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4368  phosphate acetyltransferase  49.06 
 
 
344 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2847  phosphotransacetylase  56.48 
 
 
335 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.233473  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0646  phosphate acetyltransferase  48.11 
 
 
326 aa  289  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00657462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0690  phosphotransacetylase  49.06 
 
 
345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00978626  normal  0.268816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1825  phosphate acetyl transferase  49.24 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.468792  normal  0.990644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1171  phosphate acetyltransferase  46.5 
 
 
334 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.910549  normal  0.174379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1035  phosphotransacetylase  46.36 
 
 
333 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000802178  hitchhiker  0.00000181375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1732  phosphotransacetylase  44.82 
 
 
332 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00629066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2706  phosphate acetyltransferase  45.76 
 
 
333 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.489379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1290  phosphate acetyltransferase  44.55 
 
 
334 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2276  phosphate acetyltransferase  46.36 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000840515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1947  phosphate acetyltransferase  46.06 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1994  phosphotransacetylase  48.44 
 
 
344 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172621  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10200  phosphate acetyltransferase  45.15 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000038792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3395  phosphate acetyltransferase  43.33 
 
 
333 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137184  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1696  phosphotransacetylase  44.21 
 
 
333 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.593384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1210  phosphate acetyltransferase  43.33 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270229  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4517  phosphate acetyltransferase  47.81 
 
 
363 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.448767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1978  phosphotransacetylase  43.9 
 
 
333 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2542  phosphate acetyltransferase  46.01 
 
 
333 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5955599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1029  phosphotransacetylase  44.51 
 
 
358 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0296281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1728  phosphate acetyltransferase  45.57 
 
 
332 aa  261  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0293316  normal  0.0937658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2850  phosphate acetyl/butaryl transferase  43.33 
 
 
333 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1614  phosphotransacetylase  41.28 
 
 
332 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000537063  hitchhiker  9.00938e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0620  phosphate acetyltransferase  41.16 
 
 
334 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00611746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2137  phosphate acetyltransferase  42.6 
 
 
331 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06290  phosphotransacetylase  46.45 
 
 
333 aa  252  6e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0250109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1494  phosphate acetyltransferase  42.42 
 
 
332 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000278764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1326  phosphate acetyltransferase  43.77 
 
 
331 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0780442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  44.06 
 
 
700 aa  245  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0767  phosphate acetyltransferase  40.9 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0042  phosphate acetyltransferase  40.79 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  42.37 
 
 
702 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02349  predicted phosphotransacetylase subunit  44.62 
 
 
338 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1219  phosphotransacetylase  44.62 
 
 
338 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1212  phosphate acetyltransferase  44.62 
 
 
338 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2735  phosphotransacetylase  44.62 
 
 
338 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02311  hypothetical protein  44.62 
 
 
338 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2587  phosphotransacetylase  44.62 
 
 
338 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3679  phosphotransacetylase  44.62 
 
 
338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2726  phosphotransacetylase  43.69 
 
 
338 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335854  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12240  phosphotransacetylase  44.75 
 
 
331 aa  239  4e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2659  phosphotransacetylase  43.69 
 
 
338 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.918337  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0055  phosphate acetyltransferase  40.92 
 
 
692 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2604  phosphotransacetylase  44.31 
 
 
338 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1821  phosphotransacetylase  41.23 
 
 
333 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000135779  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1082  phosphotransacetylase  42.99 
 
 
336 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2833  phosphotransacetylase  43.38 
 
 
338 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2824  phosphotransacetylase  44.31 
 
 
338 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2611  phosphotransacetylase  43.08 
 
 
338 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2700  phosphotransacetylase  42.46 
 
 
338 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  40.06 
 
 
702 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1378  phosphotransacetylase  43.21 
 
 
588 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.926541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1163  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  38.39 
 
 
478 aa  231  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.979625  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  41.01 
 
 
702 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  42.15 
 
 
695 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11260  phosphotransacetylase  43.77 
 
 
695 aa  230  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.182034  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0076  phosphate acetyltransferase  39.23 
 
 
341 aa  229  5e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  41.09 
 
 
703 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1824  phosphotransacetylase  40 
 
 
326 aa  229  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  39.44 
 
 
701 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0602  phosphate acetyltransferase  38.91 
 
 
351 aa  228  1e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3364  phosphotransacetylase  42.09 
 
 
324 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  42.3 
 
 
691 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1420  phosphotransacetylase  42.72 
 
 
327 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00576115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  42.22 
 
 
698 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  43.26 
 
 
711 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0414  phosphate acetyltransferase  41.03 
 
 
335 aa  225  7e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1231  phosphotransacetylase  38.48 
 
 
327 aa  225  9e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  41.18 
 
 
690 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  40.62 
 
 
719 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  41.77 
 
 
703 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4398  phosphate acetyltransferase  41.82 
 
 
706 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  42.01 
 
 
699 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1092  phosphotransacetylase  43.27 
 
 
330 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000027546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2896  phosphate acetyltransferase  42.72 
 
 
714 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  40.62 
 
 
704 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4072  phosphate acetyltransferase  42.14 
 
 
689 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0721  phosphotransacetylase  41.36 
 
 
566 aa  222  8e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000504699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  41.69 
 
 
709 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  42.63 
 
 
696 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34550  phosphate acetyltransferase  40.99 
 
 
712 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3472  phosphotransacetylase  42.41 
 
 
326 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1296  phosphotransacetylase  39.09 
 
 
325 aa  219  6e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  39.88 
 
 
714 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2982  phosphate acetyltransferase  41.54 
 
 
714 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3087  phosphate acetyltransferase  41.54 
 
 
714 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  37.46 
 
 
707 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0383  phosphate acetyltransferase  38.46 
 
 
711 aa  217  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  37.46 
 
 
707 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0398  phosphotransacetylase  40.79 
 
 
324 aa  217  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.294094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1220  phosphate acetyltransferase  41.25 
 
 
685 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415624  normal  0.0276025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>