More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1978 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1978  phosphotransacetylase  100 
 
 
333 aa  681    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1696  phosphotransacetylase  99.7 
 
 
333 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.593384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1171  phosphate acetyltransferase  61.08 
 
 
334 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.910549  normal  0.174379 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10200  phosphate acetyltransferase  61.21 
 
 
332 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000038792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1614  phosphotransacetylase  61.09 
 
 
332 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000537063  hitchhiker  9.00938e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1732  phosphotransacetylase  62.16 
 
 
332 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00629066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1494  phosphate acetyltransferase  56.84 
 
 
332 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000278764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0767  phosphate acetyltransferase  56.97 
 
 
330 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1029  phosphotransacetylase  56.16 
 
 
358 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0296281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2276  phosphate acetyltransferase  56.63 
 
 
333 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000840515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2137  phosphate acetyltransferase  56.76 
 
 
331 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3395  phosphate acetyltransferase  56.93 
 
 
333 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1947  phosphate acetyltransferase  56.33 
 
 
333 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1728  phosphate acetyltransferase  56.5 
 
 
332 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0293316  normal  0.0937658 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1326  phosphate acetyltransferase  57.53 
 
 
331 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0780442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1290  phosphate acetyltransferase  55.59 
 
 
334 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2706  phosphate acetyltransferase  56.02 
 
 
333 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.489379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1210  phosphate acetyltransferase  54.95 
 
 
333 aa  359  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1082  phosphotransacetylase  52.69 
 
 
336 aa  358  8e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0646  phosphate acetyltransferase  54.1 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00657462  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2542  phosphate acetyltransferase  53.92 
 
 
333 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5955599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1035  phosphotransacetylase  55.72 
 
 
333 aa  348  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000802178  hitchhiker  0.00000181375 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06290  phosphotransacetylase  52.54 
 
 
333 aa  345  8.999999999999999e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0250109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1821  phosphotransacetylase  53.19 
 
 
333 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000135779  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0620  phosphate acetyltransferase  51.52 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00611746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2850  phosphate acetyl/butaryl transferase  50.45 
 
 
333 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  52.92 
 
 
702 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  50.93 
 
 
702 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3772  phosphotransacetylase  48.62 
 
 
345 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  52.44 
 
 
704 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4368  phosphate acetyltransferase  51.57 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12240  phosphotransacetylase  53.09 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0055  phosphate acetyltransferase  50.93 
 
 
692 aa  319  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3501  phosphate acetyltransferase  48.62 
 
 
325 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.85802  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6206  phosphate acetyltransferase  49.55 
 
 
343 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235259  normal  0.547085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4398  phosphate acetyltransferase  51.88 
 
 
706 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  48.34 
 
 
703 aa  315  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1163  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  48.63 
 
 
478 aa  315  9e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.979625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0700  phosphate acetyltransferase  50 
 
 
692 aa  315  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0266359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  51.38 
 
 
719 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  51.68 
 
 
704 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  49.85 
 
 
695 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  53.25 
 
 
702 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  52.48 
 
 
709 aa  312  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  50.77 
 
 
701 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0076  phosphate acetyltransferase  50 
 
 
341 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  49.7 
 
 
704 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  49.7 
 
 
704 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  49.7 
 
 
704 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1092  phosphotransacetylase  50.15 
 
 
330 aa  310  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000027546  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  49.38 
 
 
707 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  49.07 
 
 
707 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1824  phosphotransacetylase  50.46 
 
 
326 aa  309  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  48.78 
 
 
707 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  51.38 
 
 
700 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  50.3 
 
 
699 aa  308  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0042  phosphate acetyltransferase  48.8 
 
 
335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  48.92 
 
 
690 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5516  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5180  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5441  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5238  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5085  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5636  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5481  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5510  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0579  phosphate acetyltransferase  51.52 
 
 
697 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5566  phosphotransacetylase  49.54 
 
 
323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  48.04 
 
 
689 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5068  phosphotransacetylase  49.24 
 
 
323 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1420  phosphotransacetylase  50.76 
 
 
327 aa  305  6e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00576115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3908  phosphotransacetylase  49.09 
 
 
323 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0690  phosphotransacetylase  50.93 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00978626  normal  0.268816 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1724  phosphate acetyltransferase  50.64 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  50.46 
 
 
712 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  48.18 
 
 
691 aa  302  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  50.77 
 
 
714 aa  301  7.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0398  phosphotransacetylase  49.55 
 
 
324 aa  301  8.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.294094  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4517  phosphate acetyltransferase  48.45 
 
 
363 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.448767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  49.09 
 
 
698 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2781  phosphate acetyltransferase  51.08 
 
 
712 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000660033  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1159  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  47.68 
 
 
456 aa  300  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00153705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1483  phosphate acetyltransferase  51.08 
 
 
712 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0111622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4072  phosphate acetyltransferase  48.15 
 
 
689 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2896  phosphate acetyltransferase  49.24 
 
 
714 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2560  phosphate acetyltransferase  51.08 
 
 
713 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00240878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  49.69 
 
 
697 aa  299  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3472  phosphotransacetylase  48.17 
 
 
326 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  49.23 
 
 
703 aa  299  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1384  phosphate acetyltransferase  50.77 
 
 
713 aa  298  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000919072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0813  phosphate acetyltransferase  49.7 
 
 
464 aa  298  8e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0103  hydrogenase expression/synthesis, HypA  47.99 
 
 
455 aa  298  9e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2310  phosphate acetyltransferase  49.85 
 
 
699 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2982  phosphate acetyltransferase  49.24 
 
 
714 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  48.47 
 
 
696 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3087  phosphate acetyltransferase  49.24 
 
 
714 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  50.46 
 
 
712 aa  296  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3317  phosphate acetyltransferase  49.85 
 
 
729 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000353028  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  50.31 
 
 
711 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3364  phosphotransacetylase  46.34 
 
 
324 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>