More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1029 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1029  phosphotransacetylase  100 
 
 
358 aa  723    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0296281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2137  phosphate acetyltransferase  73.11 
 
 
331 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1494  phosphate acetyltransferase  68.58 
 
 
332 aa  457  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000278764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1326  phosphate acetyltransferase  62.92 
 
 
331 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0780442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1821  phosphotransacetylase  60.98 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000135779  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1728  phosphate acetyltransferase  61.63 
 
 
332 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0293316  normal  0.0937658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10200  phosphate acetyltransferase  55.76 
 
 
332 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000038792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06290  phosphotransacetylase  57.93 
 
 
333 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0250109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12240  phosphotransacetylase  60.12 
 
 
331 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1614  phosphotransacetylase  55.18 
 
 
332 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000537063  hitchhiker  9.00938e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1171  phosphate acetyltransferase  56.59 
 
 
334 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.910549  normal  0.174379 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0646  phosphate acetyltransferase  57.67 
 
 
326 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00657462  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1732  phosphotransacetylase  57.1 
 
 
332 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00629066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1978  phosphotransacetylase  56.16 
 
 
333 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1696  phosphotransacetylase  56.16 
 
 
333 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.593384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2542  phosphate acetyltransferase  54.52 
 
 
333 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5955599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0767  phosphate acetyltransferase  53.03 
 
 
330 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3395  phosphate acetyltransferase  54.22 
 
 
333 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2276  phosphate acetyltransferase  53.31 
 
 
333 aa  342  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000840515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1947  phosphate acetyltransferase  52.71 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2706  phosphate acetyltransferase  53.01 
 
 
333 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.489379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1035  phosphotransacetylase  53.61 
 
 
333 aa  332  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000802178  hitchhiker  0.00000181375 
 
 
-
 
NC_002950  PG1082  phosphotransacetylase  48.48 
 
 
336 aa  328  7e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1210  phosphate acetyltransferase  51.06 
 
 
333 aa  322  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0620  phosphate acetyltransferase  49.55 
 
 
334 aa  320  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00611746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3772  phosphotransacetylase  48.94 
 
 
345 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1290  phosphate acetyltransferase  49.85 
 
 
334 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  48.17 
 
 
702 aa  315  8e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  48.48 
 
 
704 aa  315  9e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2850  phosphate acetyl/butaryl transferase  49.55 
 
 
333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  48.78 
 
 
719 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  49.85 
 
 
702 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4368  phosphate acetyltransferase  49.06 
 
 
344 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  47.58 
 
 
704 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  46.6 
 
 
702 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  48.15 
 
 
700 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6206  phosphate acetyltransferase  48.49 
 
 
343 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235259  normal  0.547085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  45.78 
 
 
703 aa  298  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0076  phosphate acetyltransferase  47.94 
 
 
341 aa  298  8e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  46.85 
 
 
707 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  43.68 
 
 
707 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4869  phosphate acetyltransferase  45.76 
 
 
344 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.70933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  45.51 
 
 
698 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3501  phosphate acetyltransferase  47.08 
 
 
325 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.85802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  47.72 
 
 
726 aa  295  9e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  44.11 
 
 
690 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1704  phosphate acetyltransferase  47.45 
 
 
713 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000601428  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0700  phosphate acetyltransferase  46.34 
 
 
692 aa  292  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0266359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0690  phosphotransacetylase  49.38 
 
 
345 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00978626  normal  0.268816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1826  phosphate acetyltransferase  49.54 
 
 
691 aa  292  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1442  phosphate acetyltransferase  49.54 
 
 
717 aa  292  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1550  phosphate acetyltransferase  49.54 
 
 
717 aa  292  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2773  phosphate acetyltransferase  46.97 
 
 
717 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000126217  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1690  phosphate acetyltransferase  46.97 
 
 
717 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000858344  normal  0.0172468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2675  phosphate acetyltransferase  46.97 
 
 
717 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000376999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1994  phosphotransacetylase  47.06 
 
 
344 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172621  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  45.76 
 
 
701 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2694  phosphate acetyltransferase  46.97 
 
 
717 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3317  phosphate acetyltransferase  48.2 
 
 
729 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000353028  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4517  phosphate acetyltransferase  46.93 
 
 
363 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.448767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2382  phosphate acetyltransferase  46.67 
 
 
717 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000517206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  47.27 
 
 
712 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0624  phosphate acetyltransferase  47.58 
 
 
568 aa  290  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  44.66 
 
 
712 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1384  phosphate acetyltransferase  47.89 
 
 
713 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000919072  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1551  phosphate acetyltransferase  46.2 
 
 
717 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0542172  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  44.31 
 
 
695 aa  289  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2781  phosphate acetyltransferase  48.94 
 
 
712 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000660033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2916  phosphate acetyltransferase  46.81 
 
 
717 aa  289  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  48.63 
 
 
714 aa  289  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  44.11 
 
 
707 aa  289  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  45.76 
 
 
699 aa  288  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1483  phosphate acetyltransferase  48.63 
 
 
712 aa  288  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0111622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2310  phosphate acetyltransferase  46.72 
 
 
699 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2887  phosphate acetyltransferase  46.81 
 
 
713 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000745761  decreased coverage  0.0000011303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5566  phosphotransacetylase  49.84 
 
 
323 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1490  phosphate acetyltransferase  45.9 
 
 
717 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000130652  normal  0.921429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  48.45 
 
 
711 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5516  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2560  phosphate acetyltransferase  44.57 
 
 
713 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00240878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2687  phosphate acetyltransferase  48.62 
 
 
714 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5238  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5085  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5180  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5636  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2524  phosphate acetyltransferase  48.62 
 
 
714 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.451087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2567  phosphate acetyltransferase  48.62 
 
 
714 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  45.43 
 
 
704 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5441  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1557  phosphate acetyltransferase  45.9 
 
 
717 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243482  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2479  phosphate acetyltransferase  48.62 
 
 
714 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2579  phosphate acetyltransferase  48.62 
 
 
714 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5481  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  45.43 
 
 
704 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5510  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  45.43 
 
 
704 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3908  phosphotransacetylase  49.52 
 
 
323 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1668  phosphate acetyltransferase  45.9 
 
 
715 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000363835  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0042  phosphate acetyltransferase  44.88 
 
 
335 aa  285  9e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  44.55 
 
 
689 aa  285  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>