More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0624 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0721  phosphotransacetylase  61.7 
 
 		 566 aa  689    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000504699  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0624  phosphate acetyltransferase  100 
 
 		 568 aa  1172    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  51.23 
 
 		 700 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  51.83 
 
 		 695 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  49.05 
 
 		 704 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  49.05 
 
 		 704 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  51.25 
 
 		 704 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  51.25 
 
 		 704 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  51.25 
 
 		 704 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  50.72 
 
 		 709 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  51.58 
 
 		 702 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0700  phosphate acetyltransferase  50.98 
 
 		 692 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  53.05 
 
 		 702 aa  360  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  53.35 
 
 		 719 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  51.12 
 
 		 690 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0643  phosphate acetyltransferase  52.25 
 
 		 699 aa  357  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.65849  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4398  phosphate acetyltransferase  49.3 
 
 		 706 aa  356  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  49.58 
 
 		 707 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0579  phosphate acetyltransferase  50.85 
 
 		 697 aa  352  8.999999999999999e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08770  phosphotransacetylase  56.7 
 
 		 691 aa  352  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1668  phosphate acetyltransferase  49.45 
 
 		 715 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2477  phosphate acetyltransferase  49.45 
 
 		 715 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28500  phosphotransacetylase  52.39 
 
 		 731 aa  349  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  49.72 
 
 		 712 aa  348  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  49.73 
 
 		 726 aa  348  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  50.15 
 
 		 702 aa  347  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2382  phosphate acetyltransferase  49.07 
 
 		 717 aa  347  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000517206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2694  phosphate acetyltransferase  48.8 
 
 		 717 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2773  phosphate acetyltransferase  48.8 
 
 		 717 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000126217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2675  phosphate acetyltransferase  48.8 
 
 		 717 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000376999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1690  phosphate acetyltransferase  48.8 
 
 		 717 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000858344  normal  0.0172468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2916  phosphate acetyltransferase  48.53 
 
 		 717 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1220  phosphate acetyltransferase  48.87 
 
 		 685 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415624  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  49.46 
 
 		 698 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0693  phosphate acetyltransferase  53.45 
 
 		 699 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1494  phosphate acetyltransferase  45.84 
 
 		 712 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000825995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1490  phosphate acetyltransferase  48.53 
 
 		 717 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000130652  normal  0.921429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1557  phosphate acetyltransferase  48.27 
 
 		 717 aa  342  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243482  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1163  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  46.04 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.979625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0787  phosphate acetyltransferase  52.45 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0711  phosphate acetyltransferase  52.45 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2887  phosphate acetyltransferase  48.62 
 
 		 713 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000745761  decreased coverage  0.0000011303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  48.63 
 
 		 701 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1704  phosphate acetyltransferase  47.95 
 
 		 713 aa  340  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000601428  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1551  phosphate acetyltransferase  48.07 
 
 		 717 aa  340  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0542172  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1319  phosphate acetyltransferase  52.45 
 
 		 511 aa  339  7e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  51.52 
 
 		 699 aa  339  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6197  phosphate acetyltransferase  49.44 
 
 		 714 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0813  phosphate acetyltransferase  50.68 
 
 		 464 aa  339  8e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  49.03 
 
 		 703 aa  339  9e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2591  phosphate acetyltransferase  49.86 
 
 		 714 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.171095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  53.03 
 
 		 714 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11260  phosphotransacetylase  52.44 
 
 		 695 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.182034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1550  phosphate acetyltransferase  48.35 
 
 		 717 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1442  phosphate acetyltransferase  48.35 
 
 		 717 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1826  phosphate acetyltransferase  48.35 
 
 		 691 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  50.42 
 
 		 697 aa  337  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  50.61 
 
 		 707 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  47.03 
 
 		 696 aa  335  9e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  50.3 
 
 		 707 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1483  phosphate acetyltransferase  52.6 
 
 		 712 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0111622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2781  phosphate acetyltransferase  52.6 
 
 		 712 aa  335  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000660033  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002967  phosphate acetyltransferase  51.83 
 
 		 714 aa  335  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.596051  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3317  phosphate acetyltransferase  52.29 
 
 		 729 aa  334  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000353028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7971  Phosphate acetyltransferase  52.76 
 
 		 681 aa  334  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2113  phosphate acetyltransferase  52 
 
 		 723 aa  334  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.330408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2560  phosphate acetyltransferase  53.23 
 
 		 713 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00240878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4072  phosphate acetyltransferase  47.18 
 
 		 689 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1384  phosphate acetyltransferase  52.6 
 
 		 713 aa  333  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000919072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  52.63 
 
 		 691 aa  333  5e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02943  phosphate acetyltransferase  52 
 
 		 716 aa  333  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0103  hydrogenase expression/synthesis, HypA  52 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  51.38 
 
 		 720 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2687  phosphate acetyltransferase  51.21 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2567  phosphate acetyltransferase  51.21 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2524  phosphate acetyltransferase  51.21 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.451087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2579  phosphate acetyltransferase  51.21 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2841  phosphate acetyltransferase  50.91 
 
 		 713 aa  331  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.384349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2479  phosphate acetyltransferase  51.21 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02222  phosphate acetyltransferase  51.68 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.02628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1359  phosphate acetyltransferase  51.68 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02182  hypothetical protein  51.68 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2447  phosphate acetyltransferase  51.68 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000498187  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0055  phosphate acetyltransferase  48.97 
 
 		 692 aa  330  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1355  phosphate acetyltransferase  51.68 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00139593  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2453  phosphate acetyltransferase  47.8 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3437  phosphate acetyltransferase  47.8 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2673  phosphate acetyltransferase  51.68 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0331712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2591  phosphate acetyltransferase  51.68 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000450419  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  47.67 
 
 		 712 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34550  phosphate acetyltransferase  50.15 
 
 		 712 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1159  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  50.77 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00153705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  46.11 
 
 		 703 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3692  phosphate acetyltransferase  46.18 
 
 		 691 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2310  phosphate acetyltransferase  47.51 
 
 		 699 aa  327  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  47.09 
 
 		 711 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3540  phosphate acetyltransferase  48.3 
 
 		 712 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3048  phosphate acetyltransferase  48.14 
 
 		 701 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0392547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  46.28 
 
 		 697 aa  324  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  44.27 
 
 		 683 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>