More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1212 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02349  predicted phosphotransacetylase subunit  100 
 
 
338 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1212  phosphate acetyltransferase  100 
 
 
338 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2604  phosphotransacetylase  99.7 
 
 
338 aa  682    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2735  phosphotransacetylase  99.7 
 
 
338 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02311  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  684    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2824  phosphotransacetylase  98.82 
 
 
338 aa  676    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2587  phosphotransacetylase  100 
 
 
338 aa  684    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1219  phosphotransacetylase  100 
 
 
338 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3679  phosphotransacetylase  99.7 
 
 
338 aa  680    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2659  phosphotransacetylase  89.05 
 
 
338 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.918337  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2726  phosphotransacetylase  89.05 
 
 
338 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335854  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2611  phosphotransacetylase  88.46 
 
 
338 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2700  phosphotransacetylase  88.17 
 
 
338 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2833  phosphotransacetylase  87.87 
 
 
338 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1231  phosphotransacetylase  50.47 
 
 
327 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10200  phosphate acetyltransferase  44.18 
 
 
332 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000038792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1171  phosphate acetyltransferase  43.03 
 
 
334 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.910549  normal  0.174379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4368  phosphate acetyltransferase  45.89 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0620  phosphate acetyltransferase  43.64 
 
 
334 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00611746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1824  phosphotransacetylase  44.34 
 
 
326 aa  263  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5180  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5516  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5238  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5085  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5636  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5441  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5481  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5510  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5566  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3908  phosphotransacetylase  45.72 
 
 
323 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6206  phosphate acetyltransferase  43.38 
 
 
343 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235259  normal  0.547085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5068  phosphotransacetylase  45.39 
 
 
323 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1614  phosphotransacetylase  39.21 
 
 
332 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000537063  hitchhiker  9.00938e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3364  phosphotransacetylase  44.26 
 
 
324 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0690  phosphotransacetylase  44.44 
 
 
345 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00978626  normal  0.268816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2542  phosphate acetyltransferase  45.26 
 
 
333 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5955599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0414  phosphate acetyltransferase  41.95 
 
 
335 aa  255  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1420  phosphotransacetylase  44.81 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00576115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1290  phosphate acetyltransferase  41.64 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3472  phosphotransacetylase  43.93 
 
 
326 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3772  phosphotransacetylase  43.25 
 
 
345 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3395  phosphate acetyltransferase  42.47 
 
 
333 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1092  phosphotransacetylase  42.77 
 
 
330 aa  250  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000027546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1029  phosphotransacetylase  41.03 
 
 
358 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0296281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0236  phosphotransacetylase  42.04 
 
 
329 aa  250  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1947  phosphate acetyltransferase  41.87 
 
 
333 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2276  phosphate acetyltransferase  42.26 
 
 
333 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000840515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2706  phosphate acetyltransferase  42.55 
 
 
333 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.489379  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1825  phosphate acetyl transferase  44.73 
 
 
341 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.468792  normal  0.990644 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0646  phosphate acetyltransferase  41.02 
 
 
326 aa  246  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00657462  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2850  phosphate acetyl/butaryl transferase  41.64 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0076  phosphate acetyltransferase  42.44 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0042  phosphate acetyltransferase  42.9 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1210  phosphate acetyltransferase  39.82 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1494  phosphate acetyltransferase  39.88 
 
 
332 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000278764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1296  phosphotransacetylase  39.63 
 
 
325 aa  243  5e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0611  phosphotransacetylase  41.53 
 
 
328 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0626  phosphotransacetylase  41.53 
 
 
328 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3501  phosphate acetyltransferase  43.12 
 
 
325 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.85802  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1082  phosphotransacetylase  43.27 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1696  phosphotransacetylase  41.77 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.593384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1978  phosphotransacetylase  41.77 
 
 
333 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0398  phosphotransacetylase  43.37 
 
 
324 aa  238  9e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.294094  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4869  phosphate acetyltransferase  42.86 
 
 
344 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.70933 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1732  phosphotransacetylase  40.63 
 
 
332 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00629066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1035  phosphotransacetylase  42.25 
 
 
333 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000802178  hitchhiker  0.00000181375 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1435  phosphotransacetylase  43.69 
 
 
329 aa  237  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1994  phosphotransacetylase  44.2 
 
 
344 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172621  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4009  phosphotransacetylase  45.28 
 
 
332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1008  phosphate acetyltransferase  44.62 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1640  phosphate acetyltransferase  44.62 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4275  phosphate acetyltransferase  44.62 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4517  phosphate acetyltransferase  44.51 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.448767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0767  phosphate acetyltransferase  39.88 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  43.13 
 
 
711 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2137  phosphate acetyltransferase  38.79 
 
 
331 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1724  phosphate acetyltransferase  39.56 
 
 
327 aa  228  8e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06290  phosphotransacetylase  42.54 
 
 
333 aa  227  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0250109 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1728  phosphate acetyltransferase  40.81 
 
 
332 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0293316  normal  0.0937658 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  39.75 
 
 
712 aa  226  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  39.88 
 
 
703 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1442  phosphate acetyltransferase  38.8 
 
 
717 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1550  phosphate acetyltransferase  38.8 
 
 
717 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1826  phosphate acetyltransferase  38.8 
 
 
691 aa  225  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  39.25 
 
 
700 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  42.12 
 
 
709 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  39.02 
 
 
704 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1326  phosphate acetyltransferase  38.86 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0780442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2560  phosphate acetyltransferase  38.99 
 
 
713 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00240878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2781  phosphate acetyltransferase  38.36 
 
 
712 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000660033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2113  phosphate acetyltransferase  39.63 
 
 
723 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.330408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  39.55 
 
 
696 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2579  phosphate acetyltransferase  38.99 
 
 
714 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1483  phosphate acetyltransferase  38.36 
 
 
712 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0111622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2479  phosphate acetyltransferase  38.99 
 
 
714 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3317  phosphate acetyltransferase  37.85 
 
 
729 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000353028  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2567  phosphate acetyltransferase  38.99 
 
 
714 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2687  phosphate acetyltransferase  38.99 
 
 
714 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2524  phosphate acetyltransferase  38.99 
 
 
714 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.451087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  38.63 
 
 
704 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>