More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1825 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1825  phosphate acetyl transferase  100 
 
 
341 aa  681    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.468792  normal  0.990644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4869  phosphate acetyltransferase  58.73 
 
 
344 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.70933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3501  phosphate acetyltransferase  53.75 
 
 
325 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.85802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3772  phosphotransacetylase  52.15 
 
 
345 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4517  phosphate acetyltransferase  54.49 
 
 
363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.448767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4368  phosphate acetyltransferase  52.02 
 
 
344 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6206  phosphate acetyltransferase  48.94 
 
 
343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235259  normal  0.547085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0690  phosphotransacetylase  51.39 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00978626  normal  0.268816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1994  phosphotransacetylase  52.94 
 
 
344 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172621  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2847  phosphotransacetylase  53.89 
 
 
335 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.233473  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4009  phosphotransacetylase  50.47 
 
 
332 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1494  phosphate acetyltransferase  47.96 
 
 
332 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000278764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1029  phosphotransacetylase  44.44 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0296281  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1008  phosphate acetyltransferase  48.94 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4275  phosphate acetyltransferase  48.94 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1640  phosphate acetyltransferase  49.24 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1614  phosphotransacetylase  42.99 
 
 
332 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000537063  hitchhiker  9.00938e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10200  phosphate acetyltransferase  42.77 
 
 
332 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000038792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1171  phosphate acetyltransferase  44.88 
 
 
334 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.910549  normal  0.174379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2137  phosphate acetyltransferase  42.51 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0767  phosphate acetyltransferase  42.12 
 
 
330 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5180  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5516  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5238  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5085  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5636  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5510  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5441  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5481  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5068  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3908  phosphotransacetylase  46.79 
 
 
323 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0646  phosphate acetyltransferase  45.54 
 
 
326 aa  268  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00657462  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1696  phosphotransacetylase  42.3 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.593384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5566  phosphotransacetylase  46.47 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1082  phosphotransacetylase  42.86 
 
 
336 aa  266  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1978  phosphotransacetylase  42.3 
 
 
333 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06290  phosphotransacetylase  44.38 
 
 
333 aa  265  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0250109 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3472  phosphotransacetylase  44.72 
 
 
326 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1732  phosphotransacetylase  42.94 
 
 
332 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00629066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12240  phosphotransacetylase  43.33 
 
 
331 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1728  phosphate acetyltransferase  43.29 
 
 
332 aa  259  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0293316  normal  0.0937658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3395  phosphate acetyltransferase  42.04 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1824  phosphotransacetylase  43.94 
 
 
326 aa  259  6e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2542  phosphate acetyltransferase  45.2 
 
 
333 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5955599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2706  phosphate acetyltransferase  44.14 
 
 
333 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.489379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1821  phosphotransacetylase  42.2 
 
 
333 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000135779  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1290  phosphate acetyltransferase  42.6 
 
 
334 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  44.98 
 
 
695 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0620  phosphate acetyltransferase  42.17 
 
 
334 aa  252  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00611746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1326  phosphate acetyltransferase  41.41 
 
 
331 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0780442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  42.77 
 
 
702 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1092  phosphotransacetylase  44.62 
 
 
330 aa  250  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000027546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  42.46 
 
 
704 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2850  phosphate acetyl/butaryl transferase  44.62 
 
 
333 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1035  phosphotransacetylase  43.24 
 
 
333 aa  248  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000802178  hitchhiker  0.00000181375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2276  phosphate acetyltransferase  43.07 
 
 
333 aa  248  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000840515  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  44.85 
 
 
709 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1947  phosphate acetyltransferase  43.07 
 
 
333 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1210  phosphate acetyltransferase  41.39 
 
 
333 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3364  phosphotransacetylase  42.99 
 
 
324 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02349  predicted phosphotransacetylase subunit  44.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1212  phosphate acetyltransferase  44.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3679  phosphotransacetylase  44.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02311  hypothetical protein  44.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2587  phosphotransacetylase  44.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1420  phosphotransacetylase  44.09 
 
 
327 aa  246  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00576115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  42.01 
 
 
703 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1219  phosphotransacetylase  44.73 
 
 
338 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2735  phosphotransacetylase  44.73 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2604  phosphotransacetylase  44.73 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2611  phosphotransacetylase  44.73 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1296  phosphotransacetylase  42.25 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2659  phosphotransacetylase  44.73 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.918337  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2726  phosphotransacetylase  44.73 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335854  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4398  phosphate acetyltransferase  44.55 
 
 
706 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2824  phosphotransacetylase  44.41 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1466  phosphotransacetylase  45.17 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.334514  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0414  phosphate acetyltransferase  43.71 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2833  phosphotransacetylase  44.23 
 
 
338 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  42.46 
 
 
700 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2700  phosphotransacetylase  44.41 
 
 
338 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0700  phosphate acetyltransferase  45.23 
 
 
692 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0266359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1220  phosphate acetyltransferase  43.33 
 
 
685 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415624  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  43.12 
 
 
707 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  41.64 
 
 
698 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  44.78 
 
 
691 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  42.15 
 
 
704 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  40.31 
 
 
702 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0624  phosphate acetyltransferase  40.92 
 
 
568 aa  238  9e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  43.69 
 
 
704 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  43.08 
 
 
703 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  43.69 
 
 
704 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  43.69 
 
 
704 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11260  phosphotransacetylase  43.65 
 
 
695 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.182034  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2591  phosphate acetyltransferase  42.72 
 
 
714 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.171095  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0398  phosphotransacetylase  41.87 
 
 
324 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.294094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  42.5 
 
 
702 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0076  phosphate acetyltransferase  40.95 
 
 
341 aa  236  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1163  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  41.61 
 
 
478 aa  236  3e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.979625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  43.29 
 
 
696 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>