221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05527 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05527  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30.36 
 
 
1585 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  38.83 
 
 
811 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  42.7 
 
 
931 aa  62  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0253  ankyrin repeat-containing domain protein  36.96 
 
 
238 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.664865 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  31.82 
 
 
870 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  32.64 
 
 
219 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  35.4 
 
 
223 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  33.98 
 
 
821 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  30.36 
 
 
329 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  37.36 
 
 
762 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.69 
 
 
731 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
541 aa  55.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  34.44 
 
 
278 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  30.48 
 
 
954 aa  54.7  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_8728  predicted protein  37.8 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0451478  normal  0.0226779 
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  32.61 
 
 
224 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  36.26 
 
 
426 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  39.19 
 
 
287 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  34.48 
 
 
1005 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  31.53 
 
 
469 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  38.67 
 
 
646 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.29 
 
 
1402 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  31.07 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00214  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
321 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574203  normal  0.267859 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  30.58 
 
 
865 aa  51.6  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  40.2 
 
 
483 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  32.29 
 
 
640 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  30.08 
 
 
450 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  32.38 
 
 
253 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  28.99 
 
 
368 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  30.77 
 
 
750 aa  50.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.69 
 
 
428 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3680  ankyrin  30.63 
 
 
251 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0048166  normal  0.286035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  36.45 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1183  ankyrin  35 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.35 
 
 
2413 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  34.07 
 
 
347 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  35.34 
 
 
395 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  32.41 
 
 
382 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  29.55 
 
 
395 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  40.66 
 
 
423 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1032  hypothetical protein  38.16 
 
 
250 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  31.86 
 
 
891 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0285  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  30 
 
 
200 aa  48.5  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36555  predicted protein  35.56 
 
 
192 aa  48.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  36.49 
 
 
296 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  34.48 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  33.33 
 
 
345 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  34.09 
 
 
1249 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  37.8 
 
 
431 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0103  ankyrin  40.68 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  31.86 
 
 
483 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19610  ankyrin repeat-containing protein  30.17 
 
 
353 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  34.07 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0996  hypothetical protein  30.23 
 
 
447 aa  47.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0836466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  32.97 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  29.84 
 
 
544 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  33.72 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  35.71 
 
 
2171 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0982  ankyrin  33.33 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.728447  normal  0.673104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  32.32 
 
 
223 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  30.11 
 
 
545 aa  47  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  31.03 
 
 
138 aa  47  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0296  ankyrin repeat-containing protein  31.25 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  37.14 
 
 
514 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  29.76 
 
 
723 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  44.64 
 
 
542 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  33.66 
 
 
474 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1894  ankyrin repeat protein  31.25 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0131  ankyrin  32.89 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0365  gp200  39.44 
 
 
1421 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  33.02 
 
 
578 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0577  ankyrin  35.06 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1154  ankyrin repeat-containing protein  33.65 
 
 
440 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  36.78 
 
 
855 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  27.88 
 
 
2122 aa  45.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  34.65 
 
 
218 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  29.82 
 
 
404 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  33.33 
 
 
4520 aa  45.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  30.97 
 
 
225 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3905  Ankyrin  34.69 
 
 
1112 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09003  conserved hypothetical protein  32.46 
 
 
1387 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  33.33 
 
 
200 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  31.18 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06520  suppressor protein SPT23, putative  31.87 
 
 
1417 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  31.86 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48163  predicted protein  32.08 
 
 
783 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9151  predicted protein  32.88 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00609094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  33.33 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0631  ankyrin repeat-containing protein  34.33 
 
 
504 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000258922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  36.19 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  32.89 
 
 
216 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  31.15 
 
 
250 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  28.72 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  29.2 
 
 
240 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  38.36 
 
 
321 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  31.82 
 
 
222 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  30.84 
 
 
711 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  31.11 
 
 
1101 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>