106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4388 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4388  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.792294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4680  hypothetical protein  87.22 
 
 		 227 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5289  protein of unknown function DUF938  69.2 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0698  hypothetical protein  66.82 
 
 		 225 aa  315  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3677  hypothetical protein  68.61 
 
 		 226 aa  310  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0088  hypothetical protein  68.16 
 
 		 223 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2893  hypothetical protein  63.64 
 
 		 223 aa  274  9e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4677  hypothetical protein  49.52 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4460  hypothetical protein  48.56 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3906  hypothetical protein  48.56 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  48.56 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4714  hypothetical protein  47.6 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0213695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2182  hypothetical protein  47.6 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.378961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3284  hypothetical protein  47.12 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3800  hypothetical protein  46.63 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2826  hypothetical protein  44.17 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.232142  normal  0.188578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3827  hypothetical protein  42.86 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2517  hypothetical protein  46.01 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0829  hypothetical protein  46.01 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27931  hypothetical protein  42.65 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5974  protein of unknown function DUF938  45.77 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.785993  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0685  protein of unknown function DUF938  45.24 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3089  hypothetical protein  42.03 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0147787  normal  0.0248145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0630  hypothetical protein  46.98 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.729569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0344  protein of unknown function DUF938  41.55 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4757  hypothetical protein  41.75 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1797  hypothetical protein  46.48 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0467  hypothetical protein  46.48 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0419  hypothetical protein  46.48 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8200  protein of unknown function DUF938  43.84 
 
 		 211 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2378  hypothetical protein  46.01 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2435  hypothetical protein  41.18 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.324043  normal  0.296066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2726  protein of unknown function DUF938  41.71 
 
 		 203 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  0.088544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1812  hypothetical protein  44.83 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.32253  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0939  hypothetical protein  45.37 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420428  normal  0.161735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3991  protein of unknown function DUF938  42.56 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  42.5 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4540  hypothetical protein  44.93 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5107  hypothetical protein  44.71 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2966  hypothetical protein  44.61 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0848  hypothetical protein  42.31 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0135649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2380  protein of unknown function DUF938  41.31 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1269  protein of unknown function DUF938  44.44 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2211  hypothetical protein  44.28 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.610549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2698  hypothetical protein  38.94 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1119  hypothetical protein  44.39 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1699  protein of unknown function DUF938  37.02 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3761  hypothetical protein  41.26 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.330518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1108  hypothetical protein  39.71 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.27428  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1681  protein of unknown function DUF938  36.06 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0422  SAM-dependent methyltransferase  35.1 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15941  hypothetical protein  34.3 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280673  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11201  hypothetical protein  35.1 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.581749  hitchhiker  0.00640427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0857  protein of unknown function DUF938  40.87 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1848  hypothetical protein  37.98 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2117  protein of unknown function DUF938  42.57 
 
 		 199 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1301  hypothetical protein  38.53 
 
 		 229 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0804  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1866  hypothetical protein  45.73 
 
 		 368 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0341  hypothetical protein  41.79 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  0.537452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2479  protein of unknown function DUF938  37.62 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0623373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2963  hypothetical protein  39.6 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.82842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2352  protein of unknown function DUF938  41.41 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0252083  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3247  hypothetical protein  38.97 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11626  normal  0.379736 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3564  Generic methyltransferase  38.03 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15621  hypothetical protein  36.06 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2021  hypothetical protein  39.11 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.035685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2163  hypothetical protein  38.27 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.277214  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0649  hypothetical protein  37.07 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3826  hypothetical protein  35.82 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0558  hypothetical protein  34.26 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0343452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1253  hypothetical protein  35.03 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4204  protein of unknown function DUF938  38.69 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0923  hypothetical protein  36.45 
 
 		 224 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0911  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.441859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0032  hypothetical protein  39.66 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0939152  normal  0.0653958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2108  hypothetical protein  35.51 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08081  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1854  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03448  hypothetical protein  37.93 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0568  hypothetical protein  35.64 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0140045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1025  hypothetical protein  34.18 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0302942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2306  hypothetical protein  34.33 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2194  hypothetical protein  36.56 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.645271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0092  protein of unknown function DUF938  39.7 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251165  normal  0.0214526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1919  hypothetical protein  33.83 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1783  hypothetical protein  34.91 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1834  hypothetical protein  35.68 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2863  hypothetical protein  40.4 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.124684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2529  hypothetical protein  35.44 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0489  hypothetical protein  32.52 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0105565  normal  0.158715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2050  hypothetical protein  35.1 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44816  predicted protein  32.63 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.654306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2693  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1937  protein of unknown function DUF938  35.44 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.798826  normal  0.970016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4229  protein of unknown function DUF938  39 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4080  hypothetical protein  39 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0326682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>