109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8200 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8200  protein of unknown function DUF938  100 
 
 
211 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1119  hypothetical protein  65.82 
 
 
211 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4540  hypothetical protein  67.46 
 
 
208 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1269  protein of unknown function DUF938  64.8 
 
 
211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2966  hypothetical protein  61.46 
 
 
208 aa  238  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4460  hypothetical protein  59.18 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3906  hypothetical protein  59.18 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  59.18 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2182  hypothetical protein  58.25 
 
 
213 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.378961  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3284  hypothetical protein  59.28 
 
 
213 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4714  hypothetical protein  59.9 
 
 
204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0213695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3800  hypothetical protein  58.76 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2517  hypothetical protein  57.58 
 
 
225 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0829  hypothetical protein  57.07 
 
 
225 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2378  hypothetical protein  58.08 
 
 
225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0419  hypothetical protein  57.58 
 
 
204 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1797  hypothetical protein  57.58 
 
 
225 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0467  hypothetical protein  57.58 
 
 
225 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3827  hypothetical protein  58.03 
 
 
204 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4677  hypothetical protein  58.33 
 
 
213 aa  222  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589564  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0630  hypothetical protein  59.38 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.729569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4757  hypothetical protein  52.28 
 
 
207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5974  protein of unknown function DUF938  54.69 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.785993  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2698  hypothetical protein  55.96 
 
 
261 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716681  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5107  hypothetical protein  59.59 
 
 
205 aa  201  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3089  hypothetical protein  51.52 
 
 
206 aa  198  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0147787  normal  0.0248145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2826  hypothetical protein  50.99 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.232142  normal  0.188578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2211  hypothetical protein  55.21 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.610549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1108  hypothetical protein  53.88 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.27428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2726  protein of unknown function DUF938  52 
 
 
203 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  0.088544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0344  protein of unknown function DUF938  50.76 
 
 
205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2380  protein of unknown function DUF938  49.04 
 
 
218 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0848  hypothetical protein  53.12 
 
 
298 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0135649  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0857  protein of unknown function DUF938  55.96 
 
 
209 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1699  protein of unknown function DUF938  47.21 
 
 
210 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1681  protein of unknown function DUF938  47.21 
 
 
210 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1866  hypothetical protein  56.72 
 
 
368 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2435  hypothetical protein  47.29 
 
 
206 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.324043  normal  0.296066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0685  protein of unknown function DUF938  51.24 
 
 
223 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3761  hypothetical protein  48.97 
 
 
219 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.330518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  47.69 
 
 
201 aa  174  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1812  hypothetical protein  45.32 
 
 
228 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.32253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3991  protein of unknown function DUF938  46.73 
 
 
207 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3677  hypothetical protein  43.4 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0698  hypothetical protein  45.81 
 
 
225 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1848  hypothetical protein  44.5 
 
 
205 aa  165  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0032  hypothetical protein  47.96 
 
 
198 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0939152  normal  0.0653958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0341  hypothetical protein  47.92 
 
 
214 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  0.537452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5289  protein of unknown function DUF938  46.31 
 
 
238 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0804  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4680  hypothetical protein  45.81 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121354  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0088  hypothetical protein  46.41 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498901  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2021  hypothetical protein  44.04 
 
 
201 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.035685  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27931  hypothetical protein  43.78 
 
 
214 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0939  hypothetical protein  45.63 
 
 
218 aa  160  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420428  normal  0.161735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2893  hypothetical protein  44.17 
 
 
223 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981663 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1477  hypothetical protein  37.62 
 
 
207 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2963  hypothetical protein  40.41 
 
 
198 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.82842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1253  hypothetical protein  40.62 
 
 
206 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4388  hypothetical protein  43.84 
 
 
227 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.792294  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15941  hypothetical protein  35.64 
 
 
207 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280673  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15781  hypothetical protein  36.63 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2117  protein of unknown function DUF938  44.04 
 
 
199 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.143644 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4204  protein of unknown function DUF938  44.97 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1301  hypothetical protein  38.02 
 
 
229 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0422  SAM-dependent methyltransferase  36.41 
 
 
210 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11201  hypothetical protein  36.41 
 
 
210 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.581749  hitchhiker  0.00640427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2479  protein of unknown function DUF938  39.06 
 
 
216 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0623373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1834  hypothetical protein  39.2 
 
 
214 aa  138  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1783  hypothetical protein  40.2 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2050  hypothetical protein  40.62 
 
 
214 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2352  protein of unknown function DUF938  42.42 
 
 
214 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0252083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2108  hypothetical protein  36.84 
 
 
214 aa  134  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15621  hypothetical protein  38.42 
 
 
209 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2194  hypothetical protein  39.39 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.645271  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0558  hypothetical protein  38.38 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1025  hypothetical protein  35.23 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0302942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0911  hypothetical protein  37.7 
 
 
214 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.441859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0489  hypothetical protein  38 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0105565  normal  0.158715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03448  hypothetical protein  40.1 
 
 
220 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4229  protein of unknown function DUF938  46.03 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3826  hypothetical protein  36.79 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1854  hypothetical protein  36.87 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173469  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4080  hypothetical protein  45.5 
 
 
200 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0649  hypothetical protein  35.87 
 
 
224 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2411  hypothetical protein  37.44 
 
 
215 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.333021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1937  protein of unknown function DUF938  37.62 
 
 
215 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.798826  normal  0.970016 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44816  predicted protein  38.72 
 
 
394 aa  125  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.654306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0678  hypothetical protein  35.03 
 
 
200 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0343452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2306  hypothetical protein  35.38 
 
 
204 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0568  hypothetical protein  36.87 
 
 
216 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0140045  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3018  hypothetical protein  36.79 
 
 
209 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2177  hypothetical protein  37.95 
 
 
211 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2693  hypothetical protein  34.92 
 
 
201 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591269  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08081  hypothetical protein  36.78 
 
 
176 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1919  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  121  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2422  hypothetical protein  37.62 
 
 
215 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187854  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3247  hypothetical protein  41.45 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11626  normal  0.379736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0092  protein of unknown function DUF938  39.09 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251165  normal  0.0214526 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3564  Generic methyltransferase  40.93 
 
 
211 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>