107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2050 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2050  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  446  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2194  hypothetical protein  81.82 
 
 		 214 aa  345  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.645271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1834  hypothetical protein  80.1 
 
 		 214 aa  344  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1783  hypothetical protein  82.56 
 
 		 214 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1937  protein of unknown function DUF938  72.6 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.798826  normal  0.970016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2177  hypothetical protein  73.37 
 
 		 211 aa  299  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2411  hypothetical protein  70.19 
 
 		 215 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.333021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2422  hypothetical protein  70.44 
 
 		 215 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2529  hypothetical protein  71.36 
 
 		 215 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2163  hypothetical protein  58.88 
 
 		 200 aa  245  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.277214  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1919  hypothetical protein  60.41 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2306  hypothetical protein  60.98 
 
 		 204 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2693  hypothetical protein  58.71 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1854  hypothetical protein  57.5 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2108  hypothetical protein  51.22 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2352  protein of unknown function DUF938  53.66 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0252083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0032  hypothetical protein  52.76 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0939152  normal  0.0653958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0678  hypothetical protein  49.25 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0343452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2863  hypothetical protein  50.49 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.124684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0092  protein of unknown function DUF938  48.53 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251165  normal  0.0214526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3826  hypothetical protein  51.26 
 
 		 198 aa  181  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2021  hypothetical protein  49.02 
 
 		 201 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.035685  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0568  hypothetical protein  50.25 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0140045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0558  hypothetical protein  49.75 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1253  hypothetical protein  48.99 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0649  hypothetical protein  45.93 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1025  hypothetical protein  46.43 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0302942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03448  hypothetical protein  45.85 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2963  hypothetical protein  45.96 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.82842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2117  protein of unknown function DUF938  44.22 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02858  hypothetical protein  44.62 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5974  protein of unknown function DUF938  43.78 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.785993  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2517  hypothetical protein  39.9 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1108  hypothetical protein  40.1 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.27428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3018  hypothetical protein  43.4 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0829  hypothetical protein  39.42 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2378  hypothetical protein  39.9 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0419  hypothetical protein  41.21 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1797  hypothetical protein  39.9 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0467  hypothetical protein  39.9 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2182  hypothetical protein  39.7 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.378961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3827  hypothetical protein  40.29 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4714  hypothetical protein  40.8 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0213695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1119  hypothetical protein  38.27 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3800  hypothetical protein  38.89 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1269  protein of unknown function DUF938  39.9 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0630  hypothetical protein  39.8 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.729569  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3284  hypothetical protein  38.89 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4460  hypothetical protein  39.2 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3906  hypothetical protein  39.2 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  39.2 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8200  protein of unknown function DUF938  40.62 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5107  hypothetical protein  40.95 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3761  hypothetical protein  38.1 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.330518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2211  hypothetical protein  42 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.610549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3991  protein of unknown function DUF938  39.02 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4677  hypothetical protein  37.98 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0344  protein of unknown function DUF938  37.81 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4540  hypothetical protein  37.37 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0804  hypothetical protein  36.82 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2726  protein of unknown function DUF938  37 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  0.088544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2698  hypothetical protein  35.53 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2380  protein of unknown function DUF938  34.58 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4204  protein of unknown function DUF938  34.87 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1812  hypothetical protein  37.44 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.32253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0857  protein of unknown function DUF938  36.36 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2826  hypothetical protein  34.31 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.232142  normal  0.188578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0088  hypothetical protein  37.31 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  36.41 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1699  protein of unknown function DUF938  31.68 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3089  hypothetical protein  34.65 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0147787  normal  0.0248145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0698  hypothetical protein  36.95 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4757  hypothetical protein  35.57 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0685  protein of unknown function DUF938  38.89 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2893  hypothetical protein  34.1 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27931  hypothetical protein  35.53 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4680  hypothetical protein  35.78 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1681  protein of unknown function DUF938  31.19 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2435  hypothetical protein  33.99 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.324043  normal  0.296066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0848  hypothetical protein  35.68 
 
 		 298 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0135649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4388  hypothetical protein  35.1 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.792294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1848  hypothetical protein  35.38 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0341  hypothetical protein  32.84 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  0.537452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2966  hypothetical protein  34.17 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3677  hypothetical protein  35.29 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5289  protein of unknown function DUF938  35.96 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11201  hypothetical protein  33.85 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.581749  hitchhiker  0.00640427 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0422  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0923  hypothetical protein  34.3 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2479  protein of unknown function DUF938  31.8 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0623373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1301  hypothetical protein  32.85 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08081  hypothetical protein  35.8 
 
 		 176 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4229  protein of unknown function DUF938  34.36 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0939  hypothetical protein  32.83 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420428  normal  0.161735 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15941  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0911  hypothetical protein  32.31 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.441859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1477  hypothetical protein  29.7 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1866  hypothetical protein  32.31 
 
 		 368 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15781  hypothetical protein  31.63 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>