108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0911 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0911  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.441859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1301  hypothetical protein  45.5 
 
 
229 aa  198  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2479  protein of unknown function DUF938  43.6 
 
 
216 aa  187  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0623373 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8200  protein of unknown function DUF938  37.7 
 
 
211 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3800  hypothetical protein  35.58 
 
 
213 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4460  hypothetical protein  35.78 
 
 
213 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3906  hypothetical protein  35.78 
 
 
213 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  35.78 
 
 
213 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3827  hypothetical protein  36.14 
 
 
204 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2182  hypothetical protein  35.1 
 
 
213 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.378961  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  33.85 
 
 
201 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3284  hypothetical protein  35.1 
 
 
213 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5974  protein of unknown function DUF938  35.6 
 
 
210 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.785993  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0344  protein of unknown function DUF938  34.02 
 
 
205 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0829  hypothetical protein  33.51 
 
 
225 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4714  hypothetical protein  35.08 
 
 
204 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0213695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2893  hypothetical protein  35.71 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981663 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2517  hypothetical protein  33.51 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0698  hypothetical protein  33.67 
 
 
225 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3677  hypothetical protein  34.34 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4388  hypothetical protein  35 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.792294  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2378  hypothetical protein  33.51 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2966  hypothetical protein  34.9 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0419  hypothetical protein  32.98 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1797  hypothetical protein  32.98 
 
 
225 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0467  hypothetical protein  32.98 
 
 
225 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1269  protein of unknown function DUF938  35.08 
 
 
211 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1812  hypothetical protein  31.41 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.32253  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1119  hypothetical protein  34.55 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1848  hypothetical protein  33.67 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1108  hypothetical protein  32.81 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.27428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3991  protein of unknown function DUF938  31.98 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2726  protein of unknown function DUF938  34.83 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  0.088544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4677  hypothetical protein  32.98 
 
 
213 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589564  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5289  protein of unknown function DUF938  31.5 
 
 
238 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5107  hypothetical protein  35.21 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0630  hypothetical protein  32.98 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.729569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4540  hypothetical protein  35.79 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3761  hypothetical protein  32.88 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.330518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2826  hypothetical protein  31.78 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.232142  normal  0.188578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0088  hypothetical protein  31.82 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498901  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3089  hypothetical protein  33.16 
 
 
206 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0147787  normal  0.0248145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0857  protein of unknown function DUF938  34.13 
 
 
209 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4680  hypothetical protein  32.5 
 
 
227 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121354  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2211  hypothetical protein  35.08 
 
 
210 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.610549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2117  protein of unknown function DUF938  36.13 
 
 
199 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.143644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2698  hypothetical protein  31.94 
 
 
261 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716681  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2021  hypothetical protein  35.94 
 
 
201 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.035685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1699  protein of unknown function DUF938  30.77 
 
 
210 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0939  hypothetical protein  32.16 
 
 
218 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420428  normal  0.161735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0848  hypothetical protein  31.58 
 
 
298 aa  101  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0135649  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3564  Generic methyltransferase  36.13 
 
 
211 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4757  hypothetical protein  28.35 
 
 
207 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4204  protein of unknown function DUF938  32.14 
 
 
200 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1657  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2380  protein of unknown function DUF938  28.78 
 
 
218 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1681  protein of unknown function DUF938  30.26 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0422  SAM-dependent methyltransferase  31.63 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1866  hypothetical protein  36.79 
 
 
368 aa  98.6  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11201  hypothetical protein  31.63 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.581749  hitchhiker  0.00640427 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27931  hypothetical protein  31.61 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0341  hypothetical protein  31.82 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  0.537452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2306  hypothetical protein  29.17 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15781  hypothetical protein  31.12 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3247  hypothetical protein  35.08 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11626  normal  0.379736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2194  hypothetical protein  30.33 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.645271  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1834  hypothetical protein  32.65 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2163  hypothetical protein  32.29 
 
 
200 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.277214  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1025  hypothetical protein  30.39 
 
 
203 aa  92  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0302942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1783  hypothetical protein  30.26 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3826  hypothetical protein  29.47 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1919  hypothetical protein  31.18 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2050  hypothetical protein  32.31 
 
 
214 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2435  hypothetical protein  28.87 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.324043  normal  0.296066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03448  hypothetical protein  30.91 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0685  protein of unknown function DUF938  34.03 
 
 
223 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2108  hypothetical protein  28.64 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2352  protein of unknown function DUF938  30.77 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0252083  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15941  hypothetical protein  30.61 
 
 
207 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0092  protein of unknown function DUF938  29.9 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251165  normal  0.0214526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2693  hypothetical protein  30.65 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591269  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1253  hypothetical protein  28.04 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0804  hypothetical protein  30.57 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1477  hypothetical protein  27.36 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4229  protein of unknown function DUF938  31.66 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3018  hypothetical protein  30.37 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2963  hypothetical protein  31.12 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.82842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1937  protein of unknown function DUF938  30.15 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.798826  normal  0.970016 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08081  hypothetical protein  31.82 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2422  hypothetical protein  29.5 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4080  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0032  hypothetical protein  28.5 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0939152  normal  0.0653958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0678  hypothetical protein  27.78 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0343452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1854  hypothetical protein  29.23 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173469  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0568  hypothetical protein  27.41 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0140045  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2529  hypothetical protein  29.95 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.364082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2177  hypothetical protein  29.74 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0558  hypothetical protein  25.89 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02858  hypothetical protein  29.32 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2411  hypothetical protein  30.21 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.333021  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15621  hypothetical protein  29.5 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>