24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1446 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  100 
 
 		 83 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  85.54 
 
 		 83 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  84.34 
 
 		 83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  51.22 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0051  Rv0623 family protein transcription factor  47.06 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1269  transcription factor  50 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  40.96 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11758  hypothetical protein  55.07 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0450063 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  46.34 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10619  hypothetical protein  44.05 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000401564  normal  0.419389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10634  hypothetical protein  51.81 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000344549  normal  0.468408 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4578  Rv0623-like transcription factor  39.76 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1468  hypothetical protein  65 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223626  normal  0.413876 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  43.37 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1170  transcription factor  42.86 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0632  transcription factor  43.75 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0946  hypothetical protein  43.37 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4798  transcription factor  40.91 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0005  transcription factor  37.5 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.235769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0220  Rv0623 family protein transcription factor  37.08 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.956577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2862  hypothetical protein  56.1 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1129  transcription factor  41.56 
 
 		 78 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658914  normal  0.264959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22630  Rv0623-like transcription factor  41.38 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4477  transcription factor  53.66 
 
 		 115 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>