14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0220 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0220  Rv0623 family protein transcription factor  100 
 
 		 88 aa  170  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.956577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0704  Rv0623 family protein transcription factor  70.45 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271001  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  41.57 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  43.48 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0632  transcription factor  38.04 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4798  transcription factor  39.77 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  37.08 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1269  transcription factor  43.64 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2862  hypothetical protein  55 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  35.23 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  40 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4578  Rv0623-like transcription factor  46.43 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5501  hypothetical protein  33.71 
 
 		 87 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5902  hypothetical protein  33.71 
 
 		 87 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>