12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2862 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2862  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0632  transcription factor  85.71 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  60 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  53.85 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  56.1 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4477  transcription factor  53.49 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  56.1 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  55 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  50 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0220  Rv0623 family protein transcription factor  55 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.956577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0051  Rv0623 family protein transcription factor  54.76 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4324  Rv0623-like transcription factor  28.24 
 
 		 270 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>