17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0246 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  100 
 
 		 89 aa  173  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  52.44 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  51.22 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  46.34 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10619  hypothetical protein  40.48 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000401564  normal  0.419389 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0632  transcription factor  50.82 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1170  transcription factor  40.96 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22630  Rv0623-like transcription factor  43.53 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2862  hypothetical protein  60 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  38.27 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4477  transcription factor  65.79 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0051  Rv0623 family protein transcription factor  41.18 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  42.35 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1269  transcription factor  37.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4578  Rv0623-like transcription factor  37.21 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  52.63 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4324  Rv0623-like transcription factor  28.74 
 
 		 270 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>