18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8286 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  100 
 
 		 84 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4578  Rv0623-like transcription factor  73.81 
 
 		 84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  66.27 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0051  Rv0623 family protein transcription factor  57.65 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10634  hypothetical protein  60.71 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000344549  normal  0.468408 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4798  transcription factor  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11758  hypothetical protein  55.22 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0450063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  48.19 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  42.17 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  43.37 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  41.18 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0220  Rv0623 family protein transcription factor  43.48 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.956577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1269  transcription factor  38.55 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  42.35 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4477  transcription factor  35.48 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10619  hypothetical protein  38.1 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000401564  normal  0.419389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1170  transcription factor  39.53 
 
 		 81 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0632  transcription factor  39.13 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>