13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10619 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10619  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000401564  normal  0.419389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1170  transcription factor  66.67 
 
 		 81 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  44.05 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  42.86 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  40.48 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1269  transcription factor  43.37 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  41.67 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  41.18 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10634  hypothetical protein  43.02 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000344549  normal  0.468408 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  38.1 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0051  Rv0623 family protein transcription factor  38.1 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  33.73 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0632  transcription factor  35.94 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>