16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1269 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1269  transcription factor  100 
 
 		 82 aa  163  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  78.05 
 
 		 82 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  50 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  46.34 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  45.12 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10619  hypothetical protein  43.37 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000401564  normal  0.419389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1170  transcription factor  38.55 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  38.55 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  34.88 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4578  Rv0623-like transcription factor  35.71 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5433  hypothetical protein  32.53 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.570937  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0220  Rv0623 family protein transcription factor  43.64 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.956577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  37.21 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4718  hypothetical protein  34.52 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10634  hypothetical protein  46.51 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000344549  normal  0.468408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02540  Rv0623-like transcription factor  39.76 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>