15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4578 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4578  Rv0623-like transcription factor  100 
 
 		 84 aa  166  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  73.81 
 
 		 84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  59.04 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0051  Rv0623 family protein transcription factor  55.42 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10634  hypothetical protein  53.01 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000344549  normal  0.468408 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4798  transcription factor  44.71 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11758  hypothetical protein  47.76 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0450063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  39.76 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  40.96 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  38.55 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  36.9 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1269  transcription factor  35.71 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  37.21 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4477  transcription factor  40.98 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0220  Rv0623 family protein transcription factor  46.43 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.956577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>