19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1343 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  100 
 
 		 84 aa  166  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  66.27 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4578  Rv0623-like transcription factor  59.04 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0051  Rv0623 family protein transcription factor  53.57 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10634  hypothetical protein  55.42 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000344549  normal  0.468408 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4798  transcription factor  44.05 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  40.96 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  40.96 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  40.96 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11758  hypothetical protein  44.78 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0450063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0220  Rv0623 family protein transcription factor  41.57 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.956577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4477  transcription factor  45.16 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0632  transcription factor  60 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1269  transcription factor  34.88 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  33.72 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2862  hypothetical protein  55 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0704  Rv0623 family protein transcription factor  39.08 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271001  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  52.63 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10619  hypothetical protein  33.73 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000401564  normal  0.419389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>