15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3223 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3223  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1777  hypothetical protein  73.91 
 
 		 115 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2613  hypothetical protein  74.26 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3435  hypothetical protein  64.22 
 
 		 114 aa  123  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3902  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  normal  0.162217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1701  hypothetical protein  65.62 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2023  hypothetical protein  60.58 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2072  hypothetical protein  55.24 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0463231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0888  hypothetical protein  46.3 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4164  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0599  hypothetical protein  61.97 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323945  unclonable  0.00000640043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  62.5 
 
 		 337 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  69.7 
 
 		 330 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  60.87 
 
 		 339 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  34.57 
 
 		 651 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>