14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1777 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1777  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  213  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3223  hypothetical protein  73.91 
 
 
112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2613  hypothetical protein  80 
 
 
128 aa  153  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3435  hypothetical protein  62.39 
 
 
114 aa  128  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1701  hypothetical protein  72.73 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3902  hypothetical protein  60.53 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  normal  0.162217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2023  hypothetical protein  61.4 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16563  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2072  hypothetical protein  52.17 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0463231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0888  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4164  hypothetical protein  54.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470419  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0599  hypothetical protein  60.53 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323945  unclonable  0.00000640043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  66.67 
 
 
337 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  60.42 
 
 
339 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  66.67 
 
 
330 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>