13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2072 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2072  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  209  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0463231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3902  hypothetical protein  73.83 
 
 
107 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  normal  0.162217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2023  hypothetical protein  69.16 
 
 
107 aa  153  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16563  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2613  hypothetical protein  60.82 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3223  hypothetical protein  59.05 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1777  hypothetical protein  52.17 
 
 
115 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3435  hypothetical protein  48.6 
 
 
114 aa  97.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0599  hypothetical protein  53.15 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323945  unclonable  0.00000640043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1701  hypothetical protein  52.73 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0888  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4164  hypothetical protein  39.36 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470419  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  56.41 
 
 
337 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  50 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>