14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3435 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3435  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  220  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1777  hypothetical protein  62.39 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2613  hypothetical protein  64.71 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3223  hypothetical protein  64.22 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2023  hypothetical protein  52.78 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3902  hypothetical protein  55.14 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  normal  0.162217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1701  hypothetical protein  57.41 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2072  hypothetical protein  48.6 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0463231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0888  hypothetical protein  43.14 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4164  hypothetical protein  46.51 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0599  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323945  unclonable  0.00000640043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  65.71 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  68.75 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  67.5 
 
 		 339 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>