15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2023 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2023  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  206  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16563  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3902  hypothetical protein  87.85 
 
 
107 aa  186  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  normal  0.162217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2072  hypothetical protein  69.16 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0463231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2613  hypothetical protein  63.92 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3223  hypothetical protein  60.58 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1777  hypothetical protein  61.4 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0599  hypothetical protein  59.65 
 
 
107 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323945  unclonable  0.00000640043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3435  hypothetical protein  52.78 
 
 
114 aa  100  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1701  hypothetical protein  54.05 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0888  hypothetical protein  46 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4164  hypothetical protein  47.12 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470419  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  61.9 
 
 
337 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  57.45 
 
 
339 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  67.74 
 
 
330 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2342  hypothetical protein  67.86 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.396387  normal  0.158127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>