15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1701 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1701  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  230  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1777  hypothetical protein  72.73 
 
 
115 aa  151  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2613  hypothetical protein  74.26 
 
 
128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3223  hypothetical protein  65.22 
 
 
112 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3435  hypothetical protein  57.41 
 
 
114 aa  114  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3902  hypothetical protein  56.88 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  normal  0.162217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2023  hypothetical protein  54.05 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16563  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2072  hypothetical protein  52.73 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0463231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0888  hypothetical protein  45.1 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4164  hypothetical protein  47.52 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470419  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  60.98 
 
 
337 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0599  hypothetical protein  58.44 
 
 
107 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323945  unclonable  0.00000640043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  66.67 
 
 
330 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  58.7 
 
 
339 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  32.63 
 
 
955 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>