15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3902 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3902  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  203  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  normal  0.162217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2023  hypothetical protein  87.85 
 
 		 107 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2072  hypothetical protein  73.83 
 
 		 109 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0463231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2613  hypothetical protein  68.04 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3223  hypothetical protein  62.5 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1777  hypothetical protein  60.53 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0599  hypothetical protein  64.04 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323945  unclonable  0.00000640043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3435  hypothetical protein  55.14 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1701  hypothetical protein  56.88 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0888  hypothetical protein  48 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4164  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  61.54 
 
 		 337 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2342  hypothetical protein  68.97 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.396387  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  55.32 
 
 		 339 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  67.74 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>