129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2556 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2556  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0711505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0612  deoxycytidine triphosphate deaminase  42 
 
 		 203 aa  154  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2002  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.1 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169741  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2241  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.46 
 
 		 172 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06067  hypothetical protein  39.77 
 
 		 172 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06069  deoxycytidine deaminase  42.31 
 
 		 161 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6270  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.18 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00431284  normal  0.739513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2555  (dCTP deaminase), deoxycytidine triphosphate deaminase  38.24 
 
 		 170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0227  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.18 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.75 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.11 
 
 		 180 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  36.72 
 
 		 187 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  33.33 
 
 		 178 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.22 
 
 		 191 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.22 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.28 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.63 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.95 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.05 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.28 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.79 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.16 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.84 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.97 
 
 		 179 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.75 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.8 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.58 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.2 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.22 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.53 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.26 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.21 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.22 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.32 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  30.16 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.89 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.26 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.89 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.75 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.38 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.17 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.22 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.04 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.08 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.85 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  28.25 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.1 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.63 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1411  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.15 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.47 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0737  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.22 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1658  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.44 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1763  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.44 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.8 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  27.23 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.51 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.88 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.19 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1247  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.72 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0198775  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.32 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1733  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.44 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00151185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.17 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2616  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.93 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2217  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.96 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.42 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.8 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.95 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.46 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.99 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000265475  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0671  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.23 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.014238  normal  0.109558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2455  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.99 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000233187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2575  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.99 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1889  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.99 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.0428491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.09 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.41 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.41 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.41 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  28.57 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.38 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.38 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.04 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  29.24 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.87 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.98 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0645  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.42 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2067  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.9 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000164963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1883  dCTP deaminase  29.07 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.740124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0554  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.99 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.059854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.46 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2156  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.6 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>