132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2002 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2002  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 173 aa  355  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169741  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0612  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.05 
 
 		 203 aa  252  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2241  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.7 
 
 		 172 aa  250  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6270  deoxycytidine triphosphate deaminase  46.59 
 
 		 178 aa  151  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00431284  normal  0.739513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2556  deoxycytidine triphosphate deaminase  43.1 
 
 		 224 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0711505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0227  deoxycytidine triphosphate deaminase  44.89 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06067  hypothetical protein  36.63 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.43 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.64 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06069  deoxycytidine deaminase  43.66 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.57 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.04 
 
 		 192 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.64 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.3 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.64 
 
 		 190 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.11 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.04 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.64 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.11 
 
 		 190 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.48 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.11 
 
 		 191 aa  94.4  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.64 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.64 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.64 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.64 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.57 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.36 
 
 		 201 aa  92  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.51 
 
 		 191 aa  91.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.41 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.04 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.41 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.8 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.21 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.38 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.51 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.94 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.91 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.98 
 
 		 193 aa  88.6  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.43 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.51 
 
 		 211 aa  87.8  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.04 
 
 		 191 aa  87.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.11 
 
 		 203 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.75 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2555  (dCTP deaminase), deoxycytidine triphosphate deaminase  31.58 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.64 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  31.91 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.16 
 
 		 200 aa  85.1  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.18 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.91 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.68 
 
 		 196 aa  84.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  31.69 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  32.8 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  35.47 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.52 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.48 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.65 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.38 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  30.81 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.58 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  34.65 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1247  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.65 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0198775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2156  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.29 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.7 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2067  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.71 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000164963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.58 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0671  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.17 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.014238  normal  0.109558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0737  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.84 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.65 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.72 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.64 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1411  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.16 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  31.36 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.76 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.54 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.44 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0645  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.99 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.34 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.38 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  34.78 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0395  2-deoxycytidine 5-triphosphate deaminase  33.62 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.610625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1658  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1763  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.74 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.74 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2355  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.74 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.430961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.74 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.74 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.417752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>