131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0612 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0612  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 203 aa  420  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2002  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.05 
 
 		 173 aa  252  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169741  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2241  deoxycytidine triphosphate deaminase  57.56 
 
 		 172 aa  228  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6270  deoxycytidine triphosphate deaminase  45.14 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00431284  normal  0.739513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2556  deoxycytidine triphosphate deaminase  42 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0711505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0227  deoxycytidine triphosphate deaminase  50.34 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06069  deoxycytidine deaminase  42.48 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.85 
 
 		 180 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06067  hypothetical protein  32.91 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.09 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  38.67 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2555  (dCTP deaminase), deoxycytidine triphosphate deaminase  34.73 
 
 		 170 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.58 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.22 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.76 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.51 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.39 
 
 		 189 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.87 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.73 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.5 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.69 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.69 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.69 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.41 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.91 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.77 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.8 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.92 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.45 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.68 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  30.9 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.42 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.31 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.73 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.48 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.44 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.8 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.47 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.11 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  32.76 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.55 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.1 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.94 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.9 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.05 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.49 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.75 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.48 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  32.72 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.79 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.27 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.26 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.82 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0737  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.84 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.34 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.86 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  30.52 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.68 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.19 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.48 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.11 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.69 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1411  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.95 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0671  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.47 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.014238  normal  0.109558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0152  dCTP deaminase  29.41 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.473745  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1247  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.29 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0198775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2067  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000164963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2156  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.94 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  29.59 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.13 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1883  dCTP deaminase  30.99 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.740124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.53 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.23 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.5 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.5 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  28.89 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.5 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  33.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.82 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.58 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.71 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.54 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.417752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>