10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0207 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  100 
 
 
245 aa  503  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  93.88 
 
 
245 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  59.76 
 
 
246 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  56.2 
 
 
241 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.080014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  53.25 
 
 
243 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  54.55 
 
 
242 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  52.87 
 
 
243 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  53.69 
 
 
264 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  52.87 
 
 
243 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.152301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  52.05 
 
 
241 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0321974 
 
 
-
 
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