10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5352 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  92.18 
 
 		 243 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  92.18 
 
 		 243 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.152301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  85.54 
 
 		 241 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0321974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  53.69 
 
 		 245 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  52.46 
 
 		 245 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  50.2 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  50.83 
 
 		 241 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.080014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  50.61 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  49.57 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>