10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6116 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  96.71 
 
 		 243 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  56.15 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.080014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  52.85 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  54.47 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  51.22 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  51.08 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0321974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  49.13 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  50 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.152301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  49.57 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>