10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5213 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  97.94 
 
 		 243 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.152301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  92.18 
 
 		 264 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  81.82 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0321974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  52.87 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  51.23 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  49.39 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  50.42 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.080014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  49.8 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  48.98 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>