10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5304 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.152301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  97.94 
 
 		 243 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  92.18 
 
 		 264 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  81.4 
 
 		 241 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0321974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  52.87 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  51.23 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  49.39 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  50.42 
 
 		 241 aa  231  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.080014 
 
 
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NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  50.61 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  49.8 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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