10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0169 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  100 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0321974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  81.82 
 
 		 243 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  84.71 
 
 		 264 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  80.99 
 
 		 243 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.152301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  52.05 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  50.82 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  51.02 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  51.68 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.080014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  51.43 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  51.3 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>