10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  100 
 
 
243 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  97.12 
 
 
242 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  55.97 
 
 
241 aa  260  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.080014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  54.47 
 
 
246 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  53.25 
 
 
245 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  51.63 
 
 
245 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  49.8 
 
 
243 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  51.43 
 
 
241 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0321974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  50.61 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.152301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  50.61 
 
 
264 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
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