10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4392 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.080014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  56.2 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  54.55 
 
 		 245 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  56.15 
 
 		 242 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  52.46 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  55.97 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  52.19 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0321974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  51.53 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  51.53 
 
 		 243 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.152301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  51.09 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>