More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1442 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3870  oxidoreductase, alpha/molybdopterin subunit  40.56 
 
 
769 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1442  formate dehydrogenase  100 
 
 
797 aa  1673    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0338  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  42.77 
 
 
774 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1652  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.47 
 
 
755 aa  683    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1350  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  44.35 
 
 
755 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1602  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  81.98 
 
 
780 aa  1379    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.529518  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3827  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  43.6 
 
 
777 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0364976  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0334  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  72.53 
 
 
778 aa  1247    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151726 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.73 
 
 
758 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.203079  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0692  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.73 
 
 
758 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5698  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.55 
 
 
785 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00651083 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4622  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.85 
 
 
777 aa  632  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2640  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.56 
 
 
771 aa  628  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.246289  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1486  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.74 
 
 
771 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5726  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.89 
 
 
774 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3789  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.89 
 
 
795 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.89 
 
 
795 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105471  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.53 
 
 
765 aa  621  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423554  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.69 
 
 
801 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1124  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.72 
 
 
777 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4813  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  42.24 
 
 
780 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.043971  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4065  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.64 
 
 
790 aa  621  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.44 
 
 
782 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.243354  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02385  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  41.38 
 
 
779 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1254  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  40.43 
 
 
788 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0227  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  40.43 
 
 
788 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2579  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.55 
 
 
824 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0279  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.94 
 
 
782 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66119  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1265  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.26 
 
 
774 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206664  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4280  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.64 
 
 
779 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1418  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  40.43 
 
 
788 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989756  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4390  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.64 
 
 
779 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383587  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0499  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  40.43 
 
 
788 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4468  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.38 
 
 
774 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1336  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  40.55 
 
 
788 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4815  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.08 
 
 
764 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0520753  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1071  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  40.3 
 
 
788 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0919  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  40.53 
 
 
770 aa  609  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0204  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.97 
 
 
797 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6831  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.06 
 
 
763 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0334864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4006  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.26 
 
 
774 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.758525  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  42.88 
 
 
763 aa  606  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346219  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4946  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.1 
 
 
778 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000095  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  39.62 
 
 
774 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.940943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1449  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.53 
 
 
770 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0546  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.71 
 
 
765 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_003296  RS02045  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  41.38 
 
 
764 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5407  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  40.48 
 
 
778 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4954  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.6 
 
 
781 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000466466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0256  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  39.72 
 
 
781 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0525397  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4091  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.91 
 
 
774 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6997  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.06 
 
 
759 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639959  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5597  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.69 
 
 
763 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323601  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5921  putative oxidoreductase  41.35 
 
 
773 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.642358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0271  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.72 
 
 
781 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2727  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.48 
 
 
806 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1407  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.06 
 
 
759 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7085  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.06 
 
 
759 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6422  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.06 
 
 
759 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5410  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.44 
 
 
790 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274968  normal  0.0176946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0281  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.72 
 
 
781 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6418  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.55 
 
 
759 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  normal  0.370135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1711  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.96 
 
 
769 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233368  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2417  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.03 
 
 
764 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1532  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.13 
 
 
798 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.913972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0186  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  42.47 
 
 
756 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4743  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.24 
 
 
766 aa  595  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.098191  normal  0.274274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1857  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.42 
 
 
758 aa  592  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5669  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.55 
 
 
759 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68440  putative oxidoreductase  41.61 
 
 
773 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0728605  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6817  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.41 
 
 
786 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2098  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.08 
 
 
761 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316246  normal  0.978244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3852  putative dehydrogenase  40.38 
 
 
762 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0172698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3841  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.88 
 
 
760 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136107  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2594  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.7 
 
 
773 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1162  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.08 
 
 
763 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1737  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.49 
 
 
772 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.151662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2347  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.88 
 
 
762 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5132  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  41.86 
 
 
766 aa  585  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560911  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2844  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.76 
 
 
769 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3905  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.42 
 
 
775 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.873964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2148  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.63 
 
 
761 aa  579  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.963385  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4050  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.62 
 
 
770 aa  582  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5910  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.87 
 
 
747 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02347  putative formate dehydrogenase oxidoreductase protein  39 
 
 
779 aa  579  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2057  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.25 
 
 
772 aa  581  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2381  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  39.12 
 
 
772 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2105  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  38.88 
 
 
772 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1672  putative oxidoreductase  40.12 
 
 
759 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3535  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40.05 
 
 
767 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4126  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  38.75 
 
 
776 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1690  putative oxidoreductase  40.12 
 
 
759 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01459  predicted oxidoreductase  40 
 
 
759 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2145  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  40 
 
 
759 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.636149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2156  putative oxidoreductase  40 
 
 
759 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1763  putative oxidoreductase  40 
 
 
759 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4596  molybdopterin oxidoreductase, alpha subunit  38.75 
 
 
776 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1585  putative oxidoreductase  40 
 
 
759 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.851728  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01471  hypothetical protein  40 
 
 
759 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2114  putative oxidoreductase  40 
 
 
759 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.131651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>