273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1133 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1133  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  100 
 
 
379 aa  778    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1132  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  70.66 
 
 
372 aa  532  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1071  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic solute-binding protein  66.67 
 
 
365 aa  485  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1390  thiosulphate-binding protein  66.38 
 
 
365 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1070  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic solute-binding protein  56.7 
 
 
394 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1391  thiosulphate-binding protein  53.4 
 
 
389 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  52.77 
 
 
332 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  52.44 
 
 
332 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3693  thiosulphate-binding protein  50.32 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.13 
 
 
332 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.13 
 
 
332 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.16 
 
 
332 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.33 
 
 
341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  46.29 
 
 
332 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1565  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.49 
 
 
332 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105023  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.82 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  48.09 
 
 
329 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3383  extracellular solute-binding protein  49.84 
 
 
341 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  49.84 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.33 
 
 
341 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  47.77 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  47.77 
 
 
329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  47.77 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  48.7 
 
 
329 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  47.15 
 
 
329 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.15 
 
 
329 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  47.15 
 
 
329 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  47.15 
 
 
329 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  47.15 
 
 
329 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  47.15 
 
 
329 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  47.15 
 
 
329 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  46.93 
 
 
337 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  46.84 
 
 
329 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30540  Sulfate ABC transporter-binding component-CysP-like protein  49.84 
 
 
332 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  46.84 
 
 
329 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.57 
 
 
351 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  47.23 
 
 
329 aa  296  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.6 
 
 
359 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  46.44 
 
 
351 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  46.5 
 
 
329 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.18 
 
 
337 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  49.18 
 
 
337 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.18 
 
 
337 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  45.87 
 
 
351 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.44 
 
 
356 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.38 
 
 
337 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.28 
 
 
337 aa  290  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.05 
 
 
339 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  45.21 
 
 
331 aa  289  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0814  sulfate-binding protein  46.5 
 
 
328 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3625  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.51 
 
 
332 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.3 
 
 
337 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1543  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.68 
 
 
330 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.25 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  46.75 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  46.91 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2376  thiosulphate-binding protein  48.68 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1519  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.68 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.059232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2338  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.68 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895899  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1299  thiosulfate transporter subunit  45.08 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1408  thiosulfate transporter subunit  45.08 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2769  thiosulfate transporter subunit  45.08 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.25 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2961  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.01 
 
 
338 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0170  sulfate transporter subunit  46.5 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.7 
 
 
338 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1762  thiosulphate-binding protein  48.68 
 
 
332 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.478994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4590  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.08 
 
 
342 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4806  sulfate transporter subunit  46.45 
 
 
331 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2331  thiosulphate-binding protein  49.35 
 
 
339 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2945  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
339 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2966  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
339 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1002  thiosulfate transporter subunit  45.19 
 
 
342 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.428472  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2940  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.7 
 
 
363 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0090  sulfate transporter subunit  46.77 
 
 
329 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0765  thiosulfate transporter subunit  44.34 
 
 
342 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4125  sulfate transporter subunit  46.77 
 
 
329 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.81 
 
 
342 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.68 
 
 
334 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0089  sulfate transporter subunit  46.77 
 
 
329 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.41 
 
 
341 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.98 
 
 
337 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6297  ABC thiosulphate transporter, periplasmic ligand binding protein  49.03 
 
 
339 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  45.98 
 
 
346 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  43.17 
 
 
365 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  45.83 
 
 
798 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3457  thiosulfate transporter subunit  43.91 
 
 
340 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  47.21 
 
 
335 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  46.25 
 
 
329 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  44.63 
 
 
329 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  48.54 
 
 
335 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2855  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.7 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  44.83 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  45.43 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.75 
 
 
329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  46.56 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.93 
 
 
329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2545  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.36 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437885  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1398  thiosulphate-binding protein  46.89 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.15 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>