11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0133 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0116  putative lipoprotein  99.57 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0133  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0131  lipoprotein  94.04 
 
 		 235 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5112  lipoprotein  89.36 
 
 		 235 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0063  putative lipoprotein  69.49 
 
 		 237 aa  274  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0279  putative lipoprotein  65.53 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.925672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5264  lipoprotein, putative  63.4 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4502  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72600  putative lipoprotein  36.94 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6303  putative lipoprotein  37.9 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00870  lipoprotein  45.45 
 
 		 128 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>