11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4502 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4502  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72600  putative lipoprotein  41.74 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6303  putative lipoprotein  42.47 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0063  putative lipoprotein  37.54 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5264  lipoprotein, putative  36.52 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0279  putative lipoprotein  36.52 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.925672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0116  putative lipoprotein  45.76 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0133  hypothetical protein  45.76 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5112  lipoprotein  46.61 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217331 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0131  lipoprotein  42.25 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00870  lipoprotein  47.37 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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