11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72600  putative lipoprotein  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6303  putative lipoprotein  90.34 
 
 
256 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4502  TPR repeat-containing protein  41.63 
 
 
294 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5264  lipoprotein, putative  39.22 
 
 
238 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0063  putative lipoprotein  38.22 
 
 
237 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0279  putative lipoprotein  39.61 
 
 
238 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.925672  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0116  putative lipoprotein  36.08 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0133  hypothetical protein  35.69 
 
 
235 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0131  lipoprotein  35.69 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5112  lipoprotein  32.55 
 
 
235 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00870  lipoprotein  42.11 
 
 
128 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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