11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0131 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0131  lipoprotein  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0116  putative lipoprotein  93.62 
 
 		 235 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0133  hypothetical protein  94.04 
 
 		 235 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5112  lipoprotein  88.09 
 
 		 235 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0063  putative lipoprotein  68.64 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0279  putative lipoprotein  63.4 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.925672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5264  lipoprotein, putative  62.55 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72600  putative lipoprotein  36.94 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4502  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 294 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_6303  putative lipoprotein  37.44 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_00870  lipoprotein  45.45 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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