11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6303 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6303  putative lipoprotein  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72600  putative lipoprotein  90.34 
 
 
262 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4502  TPR repeat-containing protein  42.34 
 
 
294 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5264  lipoprotein, putative  39.24 
 
 
238 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0279  putative lipoprotein  40.08 
 
 
238 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.925672  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0063  putative lipoprotein  36.48 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0116  putative lipoprotein  36.86 
 
 
235 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0133  hypothetical protein  36.02 
 
 
235 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0131  lipoprotein  36.96 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5112  lipoprotein  33.77 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00870  lipoprotein  43.42 
 
 
128 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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