11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0063 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0063  putative lipoprotein  100 
 
 
237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0279  putative lipoprotein  67.23 
 
 
238 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.925672  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5264  lipoprotein, putative  66.53 
 
 
238 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0116  putative lipoprotein  69.07 
 
 
235 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0133  hypothetical protein  69.49 
 
 
235 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0131  lipoprotein  68.64 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5112  lipoprotein  66.53 
 
 
235 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4502  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 
294 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72600  putative lipoprotein  40.25 
 
 
262 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6303  putative lipoprotein  42.35 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00870  lipoprotein  50 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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