11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0116 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0116  putative lipoprotein  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0133  hypothetical protein  99.57 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0131  lipoprotein  93.62 
 
 		 235 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5112  lipoprotein  88.94 
 
 		 235 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0063  putative lipoprotein  69.07 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0279  putative lipoprotein  65.53 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.925672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5264  lipoprotein, putative  63.4 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4502  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_72600  putative lipoprotein  36.94 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_6303  putative lipoprotein  37.9 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_00870  lipoprotein  45.45 
 
 		 128 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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