11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3380 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3380  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20500  Phage integrase  72 
 
 		 399 aa  116  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  72 
 
 		 392 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  50.59 
 
 		 364 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  38.57 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  36.84 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  40.68 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  30.67 
 
 		 401 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  30.67 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  39.29 
 
 		 733 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.31 
 
 		 429 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>