24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3017 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3017  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  904    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2659  hypothetical protein  64.71 
 
 		 444 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3251  hypothetical protein  64.22 
 
 		 443 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2510  hypothetical protein  65.88 
 
 		 443 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.973885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2095  hypothetical protein  55.32 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629039  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5099  hypothetical protein  52.71 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5558  hypothetical protein  51.65 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.651155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3121  hypothetical protein  51.82 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2302  hypothetical protein  51.97 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000035123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36375  hypothetical protein  53.04 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4010  hypothetical protein  46.68 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328091  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3908  hypothetical protein  45.24 
 
 		 499 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0384197  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1424  hypothetical protein  48.98 
 
 		 497 aa  330  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.375453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0671  hypothetical protein  39.59 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2977  hypothetical protein  63.78 
 
 		 150 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  normal  0.29912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1641  hypothetical protein  38.41 
 
 		 651 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.996629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01918  hypothetical protein  33.12 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.343555  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3923  hypothetical protein  27.72 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3096  hypothetical protein  28.74 
 
 		 729 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2818  hypothetical protein  26.74 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03051  hypothetical protein  28.08 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00894237  normal  0.803051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3277  hypothetical protein  28.74 
 
 		 730 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0257  hypothetical protein  24.24 
 
 		 755 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  38.03 
 
 		 461 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>